该院消化内科成立于1992年,是集医疗、教学、科研于一体的综合性学科。科室由胃肠专科、肝胆胰病专科和内镜室组成。设有床位32张。
科室承担着皖南医学院临床教学及临床实习生带教工作。先后选派多人赴北医大、南京军区总院和弋矶山医院进修学习。2004年成为皖南联合培养硕士点。科室拥有日本奥林巴斯H260、日本富士能4450电子染色放大内镜,并配备电子胃、肠、十二指肠镜;日本奥林巴斯ITnife2、Dualnife、ITknifenano黏膜切开刀;同位素碳-14呼气试验仪等先进设备。
主要治疗疾病有:急、慢性胃炎,功能性消化不良,胃食管反流病,消化性溃疡,胃肠肿瘤,慢性腹泻,慢性便秘,肠易激综合征,炎症性肠病,肝硬化,胰腺炎,消化道出血等胃肠道及肝胆胰脏常见病及疑难病症的诊治。