开设肝病门诊、发热门诊、肠道门诊。负责对就诊患者的传染病筛查和感染性疾病的诊治。开展急慢性病毒性肝炎、肝硬化及其并发症的诊治;其它病毒感染性疾病如流行性感冒、流行性乙型脑炎、流行性腮腺炎、病毒性肠炎等疾病的诊治;细菌感染性疾病如伤寒、细菌性痢疾、霍乱、猩红热等疾病的诊治;其它传染病如肺结核、疟疾等疾病的诊治;其它感染性疾病如肺部感染、肠道感染、败血症等疾病的诊治。
是苍南县范围内唯一的感染性疾病专科。
传染病房为温州市首家负压传染病房,消毒隔离设施科学、先进,有效避免或减少院内交叉感染。