神经内科创建于1984年，系浙江省首批医学重点学科（神经病学科）、浙江省政府第三批重点学科、2001年获准国家药品临床研究基地（神经专业）、卫生部首批专科医师（神经病学科）培训基地单位、省神经药物流行病学研究中心主任单位。领衔2项医学心理学领域“11-5、12-5重大科技支撑项目”，开展失眠、灾后、癌症等重大疾病的心理障碍干预治疗，和半球结构性失语的神经心理学机制的研究。海绵体肌反射技术对神经系统病变的定位诊断达到国内领先水平。难治性癫痫的术前定位、术中脑电监测及癫痫灶的切除治疗术，其技术手段达到了国内先进，填补了省内空白。获得浙江省人民政府科技进步二等奖二项，浙江省医药卫生创新二等奖、三等奖各一项，浙江省高校成果三等奖一项，温州市科技进步二等奖一项。担任中国免疫学会神经免疫学分会委员、中华预防医学会脑卒中预防与控制专业委员会委员、中国脑卒中预防与控制专业委员会委员、中华医学会神经营养支持专业委员会委员、中华医学会神经重症监护专业委员会（筹）委员1人，担任中国超声医学工程学会颅脑超声专业委员会副主任委员及委员2人。享受国务院特殊津贴2人。

总部院区：

神经内一科设2个病区，共拥有99张床位，医师27位，技术人员7位，其中高级职称9位，中级11位，硕士学位22位，博士学位1位。温州市"新世纪551"培养人选2人，博士研究生导师1人、硕士研究生导师5人。

神经内二科床位84张，医生25名，正高级职称3名、副高级职称8名，90%以上拥有硕士学位，有硕导2名。年门诊量八万余人次，年收治病人二千余人次。

永嘉分院：

开设床位47张，拥有医生员19人，其中主任医师2人，副主任医师2名主治医师4名主管护师4名，硕士研究生1人,康复医师1名。