肾内科是常熟市临床重点专科，建立于70年代，在诊治各种肾脏疾病，包括急慢性肾小球肾炎、肾功能衰竭、难治性肾病及各种复杂性尿路感染、肾移植术后抗排异治疗、各种风湿病、狼疮性肾炎、糖尿病肾病等方面有丰富的临床经验，尤其在血液净化等方面达到三级医院水平。
1993年率先在本市开展血液透析，1995年开展血液滤过，1996年开展血液灌流，首次在本市用血液灌流的方法抢救重症药物、毒物中毒，1997年率先在本市开展连续性肾脏替代疗法，并应用于抢救多脏器功能衰竭的病人，使医院抢救重危病人的水平有了提高。同年开展肾穿刺活检术用于诊断各种急慢性肾病，目前能常规开展血液透析、血液滤过、血液灌流、连续性肾脏替代疗法、血浆置换疗法、肾穿刺术病理活检术、动静脉内瘘术、血透长期留置导管术、腹膜透析等。其中 “血液灌流抢救重症药物毒物中毒的应用”获1997年常熟市科技成果三等奖， “甲强龙、环磷酰胺、肝素三联冲击疗法治疗难治性肾病”获2000年常熟市科技成果三等奖， “血浆置换方案的应用”获2005年卫生局新技术引进一等奖， “血浆置换配合化疗治疗多发性骨髓瘤”获2007年常熟市科技成果三等奖，“血透长期留置导管的应用”获院级新技术引进二等奖，此项目在本市也是首次开展。
专科目前拥有40张病床，血液透析机31台，血液滤过机2台，血液灌流机1台，CRRT机1台。高级职称3名，主治医师2名，其中医学硕士4名，是常熟市级医院中床位最多、拥有病人数最多的，在慢性肾病的诊疗方面具有技术优势，并对肾移植术后的病人、移植排异反应等进行长期随访。开展的“血浆置换治疗多发性骨髓瘤”、“血透长期留置导管的应用”也达到了三级医院的水平，从2006年开始重新开展和推广新型双联导管型腹膜透析治疗慢性肾功能衰竭，和传统的腹膜透析相比较，大大降低了感染率，延长了腹透的生存期，目前已初具规模，也是本市拥有腹透病人数最多的医院之一，占血透人数的30.25%，达到了中华医学会要求的比例。
