菏泽市立医院病理科的前身是菏泽地区人民医院病理科，是菏泽地区人民医院成立时建科最早的科室之一，外检工作从1960年已开始（现有档案资料证实）。四十多年来培养了大批病理学人才，如著名的病理学家--乔柏生教授（后任山东医科大学附属医院现更名为齐鲁医院病理科主任，山东省病理学会主任委员）、陈德义教授（后任无锡市妇幼保健院病理科主任），沈青青教授（后任菏泽医学专科学校病理教研室主任），徐大津教授（后任青岛市肿瘤医院病理科主任）及一批病理界前辈，如刘靖梅、段秀英、王兰会等， 为我市病理事业的发展作出了巨大贡献。近年来又培养了一批年轻有为的高尖人才，如现任齐鲁医院病理科主任的张廷国教授，莱阳中医药大学校长金鲁明教授，济宁医学院附院病理科主任张仁亚教授，联勤保障部队第九六〇医院病理科张霞教授，重庆第九人民医院病理科主任宝荣副教授等。
目前，病理科现有工作人员10人，主任医师1名，主治医师2名，研究生2名，主管技师1名及技师4名。
病理科多年来在医疗、教学、科研等方面做了大量工作。自建院以来，病理病例总数近20万例，近年来每年都以10-15%的速度增加，今年将超过10000例。随着手术的增加及临床手术医生手术中对快速诊断的需要，术中冰冻明显增加，每年达2000多例。免疫组织化学染色是目前该科常规外检普遍应用的诊断及鉴别诊断技术，可以做60多种抗体的染色检查，每年染色片能达到1000余张，并且在持续增加。由于我院是一所大型综合性医院，除少数常见病外，每年有很多疑难病理会诊。会诊总数已达300例。为全市许多患者明确了诊断，并得到及时的治疗。
病理科始终坚持以医疗质量为中心，为临床医生及患者提供满意的服务，指导临床医生对患者疾病的诊断、治疗及预后。常规病理门诊小标本规定1-2个工作日，大标本3-4工作日发报告，对特殊及疑难诊断病例及时通知临床医生。同时在乳腺、甲状腺、消化、软组织、妇科肿瘤等领域做了大量研究工作。病理科的研究工作曾获得山东省及菏泽市科技进步奖。全科近年来发表40余篇高水平的科研论文，该科主编及参加多部医学专著及菏泽医学专科学校教材的编写工作。
作为菏泽医专的协作单位，每年担负医专3年制专科生的病理学教学及实验课带教工作，在医学专科生的教学过程中不断进行改革，努力提高教学水平及教学质量， 开通了多媒体教学， 教学条件有了明显的改善，有标本齐全的病理标本室及病理实验室，建立的数码互动教室，大大提高了学生实习的效果，为学生提供病理实习的良好条件和技术平台。并协助其他科室培养几十名硕士研究生。培养的数十名进修医师遍布全市各县区，均已成为各县区的病理业务骨干。
近年来，在院领导的支持下，病理科有了长足的发展，建立了全市病理诊断中心，制定了长远规划，人材梯队建设已初见雏形，困扰多年的人才断档局面有了一定的改善，病理取材室经过改造环境及通风得到很大的改善。几十万元大型设备的添置使得病理制片质量及诊断水平有了很大提高，大大促进病理制片标准化。病理科已全部实现高质量的图文病理报告，受到广大临床医生的欢迎。
