呼吸科成立于2007年，在儿科呼吸疾病疑难重症诊治方面居市内领先地位，并承担玉溪市及周边地区儿科常见的呼吸道感染性疾病、呼吸道过敏性疾病和儿科疑难危重疾病的诊断、抢救治疗工作，深得广大患者和家属的信任，多次得到了省级专家的一致赞扬和肯定，在呼吸道疾病的诊断领域享有盛名。

2019年成为国家呼吸系统疾病临床医学研究中心网络单位。2020年被授予儿童哮喘标准化门诊。2020年云南省内首家开展小儿多导睡眠监测单位。

呼吸科拥有一支经北京、上海、重庆、山东等先进医院培养、进修的小儿呼吸专业技术人员，包括2名高级职称、10名中级职称及多名优秀中青年医师的小儿呼吸治疗团队。目前开放床位100张，由呼吸科住院部及呼吸/哮喘专科门诊、肺功能室、支气管镜室、多导睡眠监测室、雾化吸入治疗室组成。

拥有目前最先进的日本小儿OLYMPUS奥林巴斯290电子支气管镜，澳大利亚多导睡眠监测仪、德国SOMNO睡眠质量监测分析仪、德国耶格小儿肺功能仪，呼气一氧化氮检测仪、德国百瑞空气压缩喷雾治疗仪、药物导入治疗仪、过敏原测定等诊疗设备。

专科特色诊疗项目：小儿肺炎、大叶性肺炎、喘息性肺炎、儿童支气管哮喘、咳嗽变异性哮喘、过敏性鼻炎、肺部感染、支气管炎、慢性咳嗽、反复呼吸道感染、支原体感染、腺样体肥大（鼾症）、儿童阻塞性睡眠呼吸暂停、间质性肺疾病、小气道疾病、胸膜炎、儿童支气管镜下检查、诊断、灌洗治疗，气道异物取出，支气管相关疾病的介入治疗。长期开展小儿支气管哮喘及过敏性鼻炎管理及相关脱敏性治疗。