同济大学附属杨浦医院普外科是上海市杨浦区重点专科，科室在腾越路总院、延吉路安图分院、开鲁路中原分院均设有病区。全科共有普通病床131张，重症监护病床17张，共有主任医师3名，博士5名，年手术量2000余台次。
科室主要分为四个亚学科学组，分别为：
1. 胃肠外科学组：主要开展胃肠道良恶性疾病的诊治，尤其是超低位保肛技术、腹腔镜结直肠癌根治技术、炎性肠病的诊治等方面实力不俗。科室负责人尹路教授、主任医师，博士研究生导师，欧洲胃肠外科委员、中华外科学会胃肠学组委员、《中华外科杂志》、《肠内肠外营养杂志》、《肝胆胰外科杂志》、《外科理论与实践》等杂志编委，擅长结直肠癌根治术，包括标准全系膜切除术（TME）、超低位保肛根治术、女性后盆腔清扫术、男性全盆腔清扫术；家族性息肉病治疗、溃疡性结肠炎、克隆氏病综合治疗等。2014年，同济大学胃肠研究中心落户杨浦医院普外科。
2. 肝胆胰外科学组：主要医疗特色为胆道结石的微创治疗、保胆取石、转移性肝癌的综合治疗以及内镜下胆管结石取出、支架放置等。科室开展单孔腹腔镜胆囊切除术、腹腔镜胆总管切开取石术、全腹腔镜下保胆取石术、肝癌手术治疗及射频消融治疗、胰十二指肠切除术等。
3. 基本外科学组：主要医疗特色为各种腹壁疝的外科治疗，特别是腹股沟疝、切口疝、脐疝等的开放及腔镜手术治疗。能熟练开展目前流行的TAPP、TEP、IPOM等先进微创疝修补技术以及平片法、疝环充填法、Kugel等开放技术，实行对于疝病的个体化治疗，在处理高龄患者、腹透患者方面具有丰富的经验。学组采用快速康复理念，注重患者自身体验。局麻手术、腔镜手术术后恢复快、下床早、疼痛轻微，早期即可恢复日常工作及生活。
4. 血管甲状腺学组：目前位于安图分院，对甲状腺结节的诊治、小切口甲状腺手术具有丰富的经验。学组还积极开展下肢静脉病的激光治疗技术、腔静脉滤器及血管支架置入、血管溶栓及取栓等技术。
