药剂科部门设置完备，运行理念先进，拥有：药品中心供应体系，全输液集中全时调配系统，多中心协同智能药品调剂系统，保障药品供应及品质安全；互动处方审核系统，药学服务中心，保障药品使用安全。药剂科高起点规划学科平台，打造学术团队，从科研层面探索用药安全的全景及实现模式，拓展学科发展方向及影响力。近年来收获诸多荣誉，包括两次全国品管圈大赛一等奖，上海市总工会工人先锋号等。

上海市浦东医院药剂科以患者为中心，提供全流程药学服务。科室目前拥有药学专业技术人员73人，其中主任药师1人，副主任药师1人，主管（中）药师29人，药师（士）41人，硕士13人，本科学历37人。

药剂科负责组织实施全院药品的采购供应、中、西药的调剂及药品质量控制等药事管理工作，有完善的工作制度，积极推行规范化、法制化、目标化、现代化管理模式。同时药剂科还承担多家院校学生的教学和实习工作；参与药品不良反应的收集上报；开展药物咨询服务,开设慢病药学门诊；定期发布医院《用药通报》和《药物警讯》，为患者和临床提供药物信息和合理用药指导；药师下临床配合临床医生加强合理用药工作的开展；及时向医务人员介绍药学领域的新知识、新成果、新技术、新方法；迅速反映医院药品使用及管理情况。2017年被评为上海市临床药事管理优秀单位称号。2018年临床药学室荣获“上海市巾帼文明岗”称号。

药剂科下设药库、门诊药房、急诊药房、病区药房、中药房、静脉药物配置中心和临床药学室7大部门，功能齐全，设施配置完善。作为药学人员实践的教学医院，2016年3月，该院以优异成绩顺利通过市卫生计生委药政处、医院协会、三甲综合医院药事管理专家的实地评审，成为首批“上海市社区临床药师在职规范化培训基地”之一。同时药剂科常年承担浦东卫校、上海市医药高等专科学校、上海健康职业技术学院、上海中医药大学、安徽医科大学等单位药学专业学生及进修生的实习与教学任务。近年来该科还开展了多项科研课题，主要承担了上海市卫生局科研课题：《低分子肝素在老年骨折大手术中预防VTE的安全性和有效性研究》、浦东新区示范中药药剂学科建设项目：《中药房管理全流程信息化模式的探究》。2017年临床药学成功评选为浦东新区重要薄弱学科，附带课题研究内容为区域临床药师协同慢病（高血压、糖尿病）管理模式研究、陆惠平同志评选为浦东新区学科带头人，附带课题研究内容为气体信号分子H2S对心肌损伤程序性坏死的作用研究。主任顾问钟明康，是华山医院药剂科主任；业务主任王斌是华山医院药剂科副主任，曾获中国药学会“2010年度中国优秀药师”奖。持续质量改进推动药剂科的工作不断提升，该科在主任的带领下，向“管理领先、服务质优、装备精良、学术成长”的目标努力。力争为医院药学工作的发展做出新的更大贡献。