复旦大学附属中山医院眼科创建于1945年，重建于1976年，是医教研一体的科室，国家重点学科复旦大学眼科学系的组成部分。许多著名的眼科学家如郭秉宽教授、倪逴教授、蔡松年教授、陈道瑜教授、黎勉勤教授、陆国生教授和朱志忠教授都曾在该眼科工作或任眼科主任。现任主任袁非主任医师为博士生导师。

中山医院眼科继承优良传统，技术力量雄厚，现有博导及硕导共3名，各亚专业均有合理的人才梯队。眼科还拥有各种世界先进诊疗仪器与设备，为患者提供全面、合理、科学而可靠的医疗服务。眼科全年门诊量5万余人次，手术量2000余台。眼科在可调节、多焦点人工晶体植入和有晶体眼人工晶体植入手术，眼部新生血管、各种眼底血管疾病及老年性黄斑变性的研究及治疗，玻璃体视网膜疾病诊治，眼表疾病诊疗及眼部整形美容，以及眼病临床流行病研究等领域发展突出。作为有着杰出声誉的大型综合性教学医师的眼科，与多学科协作紧密，在全身疾病与眼病的临床诊疗和研究中有得天独厚的优势。

眼科历来注重青年人才培养和学科建设；多名医生留学海外，与国内外学术交流密切；和多个世界知名的研究团队开展广泛合作，抢占学科制高点；与日本大阪大学眼科结为“姐妹科室”。眼科还积极参与国内外多种医疗队，袁非主任曾作为首支国家医疗队队长，将优秀医疗资源送到“老、少、边、穷”地区，体现了高度的社会责任感。

经历80年的发展历程，复旦中山厦门医院眼科已拥有国内一流的专业人才队伍及国际先进的眼病诊疗设备，包括高清的超声乳化仪、进口眼压计、全自动视野计，蔡司高清显微镜、高清光相干断层扫描仪（OCT）、光学生物测量仪（IOL-Master）、A/B超，眼底血管荧光造影、综合验光仪、眼前段/后段照相仪、激光治疗仪，最新干眼检查及治疗仪等先进设备。此外，在干眼的综合诊治目前走在国内及世界的前沿。眼科坚持以“技术领先、服务一流”为宗旨，秉承复旦大学附属中山医院的“严谨求实”的作风，以温馨舒适的诊疗环境让每位患者有家的感觉。