复旦大学附属中山医院核医学科于1958年组建，是中国核医学的起源地之一，是复旦大学重点学科和“985”重点学科，上海市卫健委重点学科（强主体）。近5年在复旦版中国医院专科排名始终位列华东第一、上海之首，在医疗、教学和科研等方面国内领先、国际知名。

复旦中山厦门医院核医学科与复旦中山医院核医学科实行同质化管理，科室负责人为复旦中山医院资深专家，医疗水平高，技术力量雄厚，强调规范化诊疗。核医学科医、技、护配套合理，梯队完备，现有高级职称2名，博士生导师1名。科室以核医学影像诊断和医学影像的比较研究为特色，尤其在肿瘤和心脏核医学显像方面具有丰富经验。科室设备先进齐全，已经安装PET/CT成像仪1台，SPECT/CT成像仪1台，具有固体靶的医用回旋加速器，并计划安装具备全球领先技术的PET/MRI成像系统1台套，增配最新型SPECT/CT成像仪1台，现已配备8张核素治疗病床。