病理科现有医疗技术人员9人，其中高级职称2人，中级职称3人，初级职称4人，其中硕士4人，本科4人，专科1人，硕士生导师1名；设有病理取材室、诊断室、组织切片室、细胞制片室、免疫组化及特染室、分子病理室、病理资料档案管理室、负压解剖室等架构。
病理科拥有全套德国Leika病理检查设备，包括全自动组织脱水机、全自动染色机、半自动包埋机、冰冻切片机、石蜡切片机、薄层液基细胞制片机、全自动封片机、全自动打号机、离心机、全自动免疫组化机、原位杂交仪、超低温冰箱、Olympus诊断显微镜、五头多用途显微镜，图象分析扫描系统和显微镜摄像系统。常规开展活体组织检查、细胞学及薄层液基细胞检查、术中冰冻检查、免疫组织化学染色、特殊染色、分子病理检查、尸体解剖、各种动物模型的病理实验结果评估和鉴定等项目。
此外，科内专家还承担了来自全国各地的感染性疾病的疑难病例会诊工作，动物实验病理模型鉴定工作。教学方面，病理科承担了复旦大学8年制新发传染病、5年制病理教学、全国继续教育授课、住院医生带教、进修医生教学培训等；协助完成硕博士实验及毕业论文，中心设有组织标本库，主要收集肝病、艾滋病、结核及其他传染病临床样本。病理科可共享公卫中心的科学研究部平台，以结核、艾滋病相关淋巴瘤、HBV相关肝癌为主要研究方向。
近年发表论文40余篇，著书6部，申报课题6项，培养硕士研究生8名。病理科未来将加强病理学科建设，引进人才，开展感染分子病理诊断，积极参加国内外学术交流，申报各类科研课题，发表高质量论文，不断提高病理诊断水平，为把我中心病理科建设成上海市感染性疾病病理诊断中心而努力。
