内分泌代谢专业始建于1972年，2009年内分泌代谢科正式成立，目前是兵团重点学科，是兵团代谢性疾病临床医学研究中心，兵团医学会内分泌及糖尿病专委会承担单位，国家体重管理规范化诊疗门诊，国家骨质疏松防治门诊，西北垂体专科联盟委员单位，西北甲状腺联盟常务理事单位，石大一附院潜力护理专科。
科室下设内分泌病区、专科门诊，糖尿病检测室三个单元。 专业结构包括糖尿病，甲状腺相关疾病，垂体、肾上腺、性腺疾病，生长发育异常疾病，骨质疏松、痛风、肥胖、高脂血症等代谢性疾病。 科室现有医师13人，其中主任医师5人，副主任医师2人，护理人员11人。
目前拥有固定床位36张，开放床位48张，年收治病人1800人左右，门诊全年接诊量30000余人次。 现开展糖尿病、甲状腺及甲状旁腺疾病、垂体及肾上腺疾病、骨质疏松、高尿酸血症及痛风、矮小症及生长发育异常、围绝经期、肥胖等亚专业。 拥有独立筛查糖尿病及并发症的先进设备。
科室拥有雄厚的技术实力，诊疗疾病种类和水平快速提高，尤其少见病、罕见病、疑难病例的诊疗水平显著提升。
