心胸外科创建于1988年5月，在外一科（胸脑泌外科）的基础上成立独立的心胸外科。三十多年来，经过心胸外科5代人的努力，心胸外科逐步发展壮大至今形成了心外科及胸外科2个临床诊疗方向。
目前是兵团胸外科质量控制中心、石河子大学硕士研究生授予点、胸痛中心核心科室。科室配备医生12人，主任医师2人，副主任医师4人，主治医师5人、住院医师1人；其中副教授2人，讲师5人；在读博士研究生2人，硕士研究生7人。护理人员23人，主管护师13人，护师10，其中讲师2人，助教6人。
心胸外科现有床位34张，普通病床26张，监护床位8张。科室拥有多功能生命体征监护仪12台，微量输液泵34台，呼吸机6台，临时心脏起搏器1台，除颤仪2台，血气分析仪1台。与多家医院建立多学科联盟，承担兵团级胸外科专业医疗质量控制中心工作。全科先后多次被医院、医学院、大学评为优秀先进科室及班组，多人次获优秀个人称号，在兵团内取得了很好的口碑。
