妇科是集医疗、教学和科研于一体的省部级重点建设学科，教育部硕士学位授予点、卫健委妇产科住院医师规范化培训基地，兵团妇科医疗质量控制中心主委单位，国家妇产疾病临床研究分中心，兵团妇产疾病临床研究中心。
设有普通妇科、妇科肿瘤、妇科盆底和妇科内分泌4个亚专业，同时拥有妇科肿瘤实验室。现有固定床位40张，医护人员31人。副高级以上专家10人（含国务院特殊津贴专家1人），华中科技大学兼职博导1人，石河子大学硕士研究生导师9人。
现有博士学历3人，在读博士3人，实现全体医师硕士以上学历。 科室拥有雄厚的技术力量及先进设备，能高水平完成妇科常见病、多发病和疑难重症的诊治，尤其在妇科良恶性肿瘤、盆底功能障碍性疾病的腹腔镜或宫腔镜微创诊疗方面，特色明显，引领着兵团和疆内妇科专业的发展和创新。科室年门诊量5.1万人次，年住院病人2500人余次，年手术量近两千台次。
经历近70年风雨，石大医一附院妇科医护将继续秉承务实、拼搏、团结、奉献的工作作风，努力打造一流团队，为保障女性健康，推动医学发展做出自己的贡献。
