戒毒科，成立于1994年4月，是由总后卫生部批准、并报北京市卫生局备案，专门收治各类物质滥用病人的特殊医疗科室，是国家卫生部戒毒新药临床药理基地。

十余年来，该科针对特殊病种、特殊人群建立“自愿戒毒，封闭管理”模式，制定了一套入院、就诊和病区管理的规章制度，对患者进行法制教育和健康教育，保证了治疗成功率和病区秩序。

科室坚持临床科研和学科建设，在秦伯益院士指导下系统验证了国内外戒毒药物和戒毒方案，探索并不断完善了一套安全、高效、不成瘾的“中西药联合梯度戒毒方案”，自1994年至2008年已用于8000多名来自北京及全国20多个省包括香港和澳大利亚、新加坡等国内、外各类自愿戒毒患者，在多次国际、国内学术会议介绍，并在国内二十余家戒毒机构推广应用。

该科充分发挥综合医院的优势，对中毒昏迷者未知毒品以及吸毒者多药滥用可及时做出诊断分析。及时成功抢救中毒昏迷、严重并发症（包括哮喘持续状态、破伤风、脑脓肿、败血症、急性坏死性胰腺炎等）。该科还积极治疗躯体和精神合并症。建立随访制度，设专家门诊，对出院后的患者继续心理咨询，指导用药，继续指导纳曲酮维持治疗，同时积极治疗失眠、疼痛、焦虑等稽延性戒断症状，提高了戒毒后的操守率。