病理科是集医疗、教学、科研于一体的现代化病理科，省级临床重点专科、江苏省住院医师规范化培训临床病理科专业培训基地，江苏省病理科医师协会副会长单位，江苏省抗癌协会肿瘤病理专委会副主委单位，徐州市病理学会主委单位，徐州市病理质控中心主委单位，牵头徐州市病理会诊中心，服务范围辐射苏鲁豫皖地区，是淮海经济区病理学术交流的中心。
病理科成立于1992年，历经30年发展，以患者为中心，以临床诊疗需求为导向，以不断提高病理诊断质量为目标，不断发展壮大。在徐医附院转型发展的大环境下，近年着力发展分子病理检测，成为淮海经济区内率先落地开展NGS的三甲医院实验室，不仅将病理诊断提高到分子水平，同时为临床进行个性化精准治疗提供依据。
除常规病理检测外，科室拥有淋巴瘤、甲状腺乳腺、女性生殖、消化道早癌等亚专科，开展神经肌肉活检、肝肾移植病理等特殊检测。
同时病理科承担部分本科生、研究生、留学生，以及规培进修生的教学工作；病理学科临床与实验病理学实验室是徐州市重点实验室，拥有形态学、免疫荧光、免疫组化与组织化学实验室、激光显微切割室、组织芯片制作室、标准PCR实验室、细胞培养室等科研平台，为开展临床研究提供了良好保障，确保医教研协同发展。
