药剂科是以病人为中心，以临床药学为基础，对临床用药全过程进行有效的组织实施与管理，促进临床科学、合理用药的药学技术服务部门。由药事管理、质量监控、临床药学、药学信息、制剂、药品调剂、药品供应、临床药理及药学实验室等部分组成。现有药学技术人员101人，其中博士研究生1名、硕士研究生11名、大学本科生50名。高级职称4人，中级职称42人。

临床药学：现有药师13人，其中临床药师6人，常年开展以合理用药为核心的临床药学工作，参与临床病例的讨论、治疗，为患者提供药学技术服务，为医院提供各项合理用药基础数据与评价指标。同时还承担着处方点评、抗菌药使用监测、用药错误监测与上报、药物不良反应监测等工作。药剂科收集、整理、分析、上报药品不良反应信息，每年上报药物不良反应报表100余份，为临床安全、合理用药提供了保证，连续多年被评为“北京市先进集体”。

药学信息：掌握药学信息是发展医院药学的重要手段，药学信息组负责收集国内外药学情报资料，了解药物研究、应用的动态和进展，及时筛选出相关的信息，定期编写、出版我院《儿科药讯》、《合理用药信息通报》，为临床提供循证依据。同时登载相关政策法规、本院用药动向及存在问题、药物不良反应、新药介绍等内容，受到临床医生们的欢迎。定期更新本院《药物手册》，为医生正确开具处方提供便利。

制剂中心：自建院以来，一直本着服务于临床的宗旨对儿科特色制剂进行研制和生产。现有正式批文的法定制剂11种，非法定制剂25种，年产值850万元。这些制剂在我院的医疗、教学和科研工作中发挥了重要作用，以“疗效显著、使用安全、价格低廉”深受临床医生、广大患儿及家长的欢迎，也为临床用药提供了更多选择。同时，制剂中心以我院著名老中医方剂为基础研发新的医院制剂，为患者生产品质可靠、安全有效的中西药特色制剂。

质量监控：建立健全药剂科质量监控组织、制度及全院药品质控网络，定期面向临床科室及患者做对药学工作的满意度调查。组织召开质控会议，总结和提升质控工作水平，提高药学技术服务质量。

药品调剂：目前门诊药房全部实施了药品计算机网络化管理，主要承担门诊病人的收方、审核、调配、发药工作，全年调配处365万余张。按照《药品管理法》对麻醉药品、精神药品、毒性药品、易燃易爆药品进行管理。急诊药房负责急诊病人及留院观察病人用药的调剂，24小时全天候服务。病房药房承担着全院34个病区1100余张病床的药品及其它治疗、检查、诊断等辅助药品的调剂工作。同时还与临床密切配合做好对住院病人在治疗期间的用药监护，确保临床用药安全、合理、有效。

用药咨询：药剂科积极创建具有儿童特色的“用药咨询中心”，设置了独立场地空间，安排专职人员利用面谈、电话、微博、邮箱等开展用药咨询服务。儿童药物咨询微博拥有粉丝万人以上，曾在政府影响力排行榜排名第21，深受广大患者信赖。咨询药师设计并制作了大量的科普宣传册，并利用宣传栏、网站、CCTV、广播电台、邮箱、咨询电话等途径进行儿童合理用药宣传。同时还深入社区、学校对孩子家长做儿童安全用药教育。药师们还根据儿童性格特点设计了涂鸦墙和患者联系卡，深受患儿喜爱。与OTC(非处方)协会合作制作了《儿童合理用药早知道》系列期刊、与白求恩基金会及全国多家儿童医院联合出版了《儿童用药百问百答》系列丛书指导患儿及家长合理用药。目前，我们正在试用现有的市场用药咨询软件，并在此基础上进行改进开发，使之成为适合儿童用药咨询服务的信息软件系统，为儿童提供个性化的用药指导。

药品供应：药品供应组是我院药品储存和供应的基地，我院现有中、西药品种800余个，目前使用先进的药品管理平台完成全院药品的采购、保管、储存、供应工作。

临床药理中心：临床药理中心是药剂科的重要组成部分，中心总面积400m2,下设分析实验室、精密仪器室、质谱室、基因扩增实验室、治疗药物监测室、会议室、临床药理室等。配备有三重四极杆-液相质谱(LC/MS/MS)、超高效液相色谱、高效液相色谱仪、基因扩增仪、免疫荧光药物浓度分析仪等多种检测设备。负责组织管理全院的药物临床试验，其行政上直属院长领导，业务上受SFDA指导和督察。组织完成新药II、III、IV期临床试验。到目前为止，共有被批准的专业组18个，中心秉承“方法科学、操作规范、管理完善、服务优质”的精神，不断改善研究条件、加强研究能力、提高研究水平，为打造国内一流的儿童临床药理研究中心不懈努力。

科室还承担着培养药学专业本科生、大中专生的教学实习任务。2013年被北京大学药学院授予“北京大学药学院专业学位研究生培训基地”。